云南藥山國家級自然保護(hù)區(qū)位于云南高原東北部，全部保護(hù)面積分布于昭通市巧家縣境內(nèi)9個鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）34個行政村，總面積20141hm2，其中核心區(qū)面積8033hm2，緩沖區(qū)面積7211hm2，實驗區(qū)4897hm2。

藥山自然保護(hù)區(qū)由藥山片區(qū)和蕎麥地河下游的楊家灣片區(qū)組成。云南藥山國家級自然保護(hù)區(qū)是森林生態(tài)系統(tǒng)類型的自然保護(hù)區(qū)，保護(hù)對象為巧家五針?biāo)伞⒃鷳B(tài)亞高山沼澤化草甸濕地生態(tài)系統(tǒng)、第四紀(jì)冰期地質(zhì)遺跡和50余種國家重點保護(hù)野生植物，40余種國家一、二級重點保護(hù)野生動物，856種中藥材。

重要地質(zhì)遺跡以藥山山頂面為代表，發(fā)生于青藏高原大規(guī)模抬升前的燕山期至喜山期中晚階段的古夷平面，大致形成于白堊紀(jì)至中新世，在云南高原東北部、貴州、四川南部有代表意義。第四紀(jì)冰期遺跡是以藥山頂面為代表，殘留于海拔3800~4041.6m，面積16km2以上，坡度小于10o，保留有上百個冰蝕湖，山頂邊緣的古冰斗變?yōu)楹庸仍搭^，是迄今為止發(fā)現(xiàn)的面積最大的古冰川遺跡之一。在金沙江和牛欄江峽谷地段，河谷深切達(dá)2500m以上，兩岸分布有多級階地，尤以藥山自然保護(hù)區(qū)西部的金沙江峽谷為突出。

巧家五針?biāo)蒔inus squamata X.W.Li，科中文名：松科，屬中文名：松屬，其他俗名:五針白皮松，保護(hù)級別：國家I級保護(hù)。